赵敏赫（池城 饰）是个出身显赫的富家公子，却因家庭压力和女友智熙分手，和国会议员之女申世妍（李多喜 饰）订下政治婚姻，此后便过上了花天酒地的混账日子，以此麻痹内心的痛苦。而在城市的另一端，姜友静（黄静茵 饰）过着完全不同的生活，她每天忙碌充实，拼命打工赚钱，和交往七年的男友安度勋（裴秀彬 饰）马上就要结婚，对未来充满期待。
本该毫无交集的四个人，命运却因一场车祸紧紧缠绕在一起。一个雨天，安度勋开车时意外撞死了人，而被撞的偏偏是赵敏赫心爱的前女友智熙。看着男友惊慌失措的样子，想到两人即将到来的婚礼和他的大好前程，友静做出了一个沉重的决定 —— 替安度勋顶罪。她扛下了所有罪责，锒铛入狱，把自由和未来都押给了爱情。
失去挚爱的赵敏赫悲痛欲绝，当得知 “肇事者” 是姜友静后，他发誓要用尽一切手段向这个 “杀人凶手” 复仇。他收起往日的颓废，变得冷酷而偏执，开始一步步接近刚出狱的友静，设下各种圈套，想要让她尝尽痛苦。而毫不知情的友静，还在为守护了男友的前程而欣慰，对即将到来的报复一无所知。
电影里充满了虐心的情节：友静在狱中思念安度勋的泪水，赵敏赫得知智熙死讯时的崩溃；友静出狱后面对赵敏赫刁难的无助，赵敏赫在报复时眼中闪过的挣扎。随着接触增多，赵敏赫渐渐发现友静并非他想象中那般冷血，她的善良和坚韧让他产生了困惑，复仇的决心开始动摇。
与此同时，安度勋的真面目慢慢暴露。他靠着友静的牺牲保住了前程，却在她入狱期间逐渐疏远，甚至对赵敏赫的报复视而不见。申世妍也发现赵敏赫的心从未在自己身上，他的复仇背后藏着深深的爱意，这段政治婚姻早已名存实亡。
四人的关系变得越来越复杂：友静在对安度勋的失望和对赵敏赫的恐惧中挣扎；赵敏赫在复仇的快感和对友静的异样情愫里徘徊；安度勋在愧疚和自私间摇摆；申世妍在骄傲和不甘中痛苦。真相像一层薄纸，随时可能被捅破，而每个人都在谎言和秘密中越陷越深。
当安度勋肇事的真相最终揭开时，所有人都被推向了崩溃的边缘。赵敏赫才明白自己恨错了人，友静才知道自己的牺牲多么不值。《秘密》用一场车祸引发的连锁反应，展现了爱情里的牺牲与背叛、仇恨里的挣扎与救赎。四个男女在命运的漩涡中互相伤害又彼此牵绊，最终在虐恋中明白：秘密终究会被揭开，而真诚与担当才是走出困境的唯一出路。
