幼儿房间隔缺损的严重程度取决于缺损的大小和症状。多数小型缺损可能自行闭合，不需要特别治疗；而大型缺损或伴随明显症状时则需要医疗干预。
小型房间隔缺损直径通常小于5毫米，早期可能没有明显症状，仅通过心脏杂音被发现。这类缺损在2岁前有较高概率自然闭合，日常需定期进行超声心动图监测，并避免剧烈运动。部分患儿可能出现轻微活动后呼吸急促或生长迟缓，但大多数情况下不影响正常生活。喂养时建议少量多餐，保证『高蛋白饮食』以促进发育，同时要避免呼吸道感染，以防心功能恶化。
大型缺损或继发肺高压可能导致反复肺炎、喂养困难、体重不增等症状。长期心脏负荷增加还可能导致右心室扩大，严重时甚至引发艾森曼格综合征。治疗方法包括经导管封堵术或开胸修补术，术前需控制肺部感染并纠正营养不良。合并肺动脉高压者需使用药物如波生坦片或西地那非片来降低肺血管阻力，术后可能还需长期服用阿司匹林肠溶片预防血栓。
家长应每3-6个月带孩子复查心脏超声，观察缺损变化情况。日常生活中应注意预防感冒，及时接种流感疫苗和肺炎疫苗。如果孩子出现口唇青紫或呼吸困难，应立即就医。母乳喂养可以提供免疫保护，添加辅食后应补充铁剂以预防贫血，减轻心脏负担。
