凌晨腹痛尿频腰酸可能是肾盂肾炎、输尿管结石、膀胱炎、肾结核、肾小球肾炎等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便进行针对性治疗。
1.肾盂肾炎
肾盂肾炎是由细菌感染引起的肾脏炎症，会导致尿频、尿急、尿痛等症状。当病原体侵入泌尿系统时，会引起局部黏膜水肿和渗出，导致腹痛。患者可以在医生指导下使用抗生素进行抗感染治疗，如头孢曲松钠、左氧氟沙星等药物。
2.输尿管结石
输尿管结石由肾脏排出的晶体物质在输尿管内凝结形成，可引起剧烈腰腹部绞痛并向会阴部放射，还可伴有血尿。输尿管受到结石刺激后会发生痉挛性收缩，进而引起腰部疼痛。对于较小的结石，可通过大量饮水促进排泄；若结石较大，则需考虑体外冲击波碎石术。
3.膀胱炎
膀胱炎通常由细菌上行感染所致，此时由于炎症因子刺激，会出现尿频、尿急以及尿痛的症状，还可能会出现下腹部不适的情况。炎症因子持续刺激会导致膀胱壁充血水肿，严重时还会导致肌肉痉挛而引起疼痛。患者可以遵医嘱服用阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物缓解不适症状。
4.肾结核
肾结核是结核分枝杆菌侵犯肾脏所引起的慢性特异性感染性疾病，典型表现为低热、盗汗、乏力、食欲减退、消瘦等全身中毒症状，以及尿频、尿急、尿痛等泌尿系症状。结核分枝杆菌对肾脏造成损伤，导致肾功能受损，从而引起腰痛。患者需要及时就医，在医生指导下使用异烟肼片、利福平胶囊等抗结核药物进行治疗。
5.肾小球肾炎
肾小球肾炎是由多种原因导致的双侧肾脏免疫介导的变态反应性疾病，可表现为血尿、蛋白尿、水肿和高血压，常有乏力、疲劳、腰酸背痛等非特异性症状。肾小球肾炎患者的肾小球滤过率下降，导致体内废物和液体潴留，引起腹胀和尿频，同时炎症反应会引起腰背部不适。患者可在医生指导下使用环磷酰胺注射液、甲泼尼龙注射液等药物缓解不适症状。
建议患者定期监测血压、血糖水平，以预防相关并发症的发生。必要时，应进行尿常规、尿培养、超声检查等进一步评估病情。
