细菌性阴道炎通常是由多种微生物引起的阴道微生态失衡所致，其中以厌氧菌为主导。
细菌性阴道炎的发生与厌氧菌过度繁殖有关，因为厌氧菌在无氧环境下能够快速生长。当阴道内环境发生改变时，例如乳杆菌减少，其他微生物如加德纳菌、普雷沃菌等会过度繁殖，产生有害物质，刺激阴道黏膜，引发炎症反应。
虽然细菌性阴道炎的主要原因是厌氧菌感染，但不排除有其他致病菌的存在，如革兰氏阳性球菌、链球菌等。这些细菌也可能引起类似症状，但较为少见。
治疗细菌性阴道炎应避免使用抗生素，因为这可能会破坏正常的阴道菌群平衡，导致耐药性的增加。患者可在医生指导下使用甲硝唑或克林霉素等抗厌氧菌药物来治疗。
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