分泌性中耳炎的病程一般为7-14天，但实际时间会受到多种因素的影响，如病因、年龄、治疗及时性、咽鼓管功能状态以及是否合并感染等。
病毒性感染引起的分泌性中耳炎通常病程较短，大约一周可以自愈；而细菌性感染或过敏因素导致的病程可能延长至2-3周。病毒性中耳炎多由流感病毒和腺病毒引起，细菌性则以肺炎链球菌和流感嗜血杆菌为主。明确病因后针对性使用抗病毒药物或抗生素可有效缩短病程。
儿童患者的病程常比成人长3-5天，尤其是2岁以下的婴幼儿，由于咽鼓管发育不完善，免疫系统未成熟，病程平均可达16天。而成人患者平均病程为10天左右。
发病72小时内接受规范治疗可显著缩短病程30%-50%。早期使用鼻用糖皮质激素如布地奈德改善咽鼓管功能，配合黏液溶解剂乙酰半胱氨酸促进积液排出。延误治疗可能导致中耳积液机化，病程延长至一个月以上。
存在腺样体肥大、鼻窦炎等基础疾病者，因持续性咽鼓管功能障碍，病程可达3-4周。这类患者需同时治疗原发病，必要时行腺样体切除术。咽鼓管功能评估显示通气不良者的病程较正常者平均多8.3天。
合并急性鼻炎或鼻咽炎时，病原体持续经咽鼓管逆行感染，病程延长超过50%。需联合治疗上呼吸道感染，使用生理盐水鼻腔冲洗减少病原体负荷。合并细菌性鼻窦炎者需加用阿莫西林克拉维酸钾等抗生素。
在病程中，建议保持充足睡眠，每日饮水1500-2000毫升稀释分泌物。避免用力擤鼻及乘坐飞机，咀嚼无糖口香糖有助于促进咽鼓管开放。急性期暂缓游泳，饮食宜清淡，限制乳制品摄入以减少黏液分泌。若两周未愈或出现听力明显下降、耳痛加剧，需及时复诊，排除胆固醇肉芽肿等并发症可能。恢复期可进行捏鼻鼓气训练，每日三次改善咽鼓管功能。
