基本信息
- 英文名称：Hepatitis Virus C NS3 Protease Inhibitor
- 中文名称：丙型肝炎病毒 NS3 蛋白酶抑制剂
- 氨基酸序列：N - 乙酰基 - 天冬氨酸 - 谷氨酸 - 二氟苯丙氨酸 - 谷氨酸 - 环己基丙氨酸 - 半胱氨酸
- 单字母序列：Ac-DE-Dif-E-Cha-C
- 三字母序列：Ac-Asp-Glu-Dif-Glu-Cha-Cys
- 分子量：913.00
- 分子式：C₄₃H₅₆N₆O₁₄S
- CAS 号：208939-95-1
- 等电点：无明确理论计算值，因含多个酸性和碱性氨基酸，推测偏酸性
- 供应商：上海楚肽生物科技有限公司
结构信息
该抑制剂是一种多肽类化合物，包含特定的氨基酸序列，其中 N 端为乙酰基修饰，含有二氟苯丙氨酸（Dif）这种特殊的氨基酸，可能对其与 NS3 蛋白酶的结合特异性和亲和力有重要作用，环己基丙氨酸（Cha）的环己基结构也可能参与和靶点的疏水相互作用等，半胱氨酸（Cys）可能在形成分子内或分子间的二硫键等方面有潜在作用，从而影响其空间结构和功能。
作用机理及研究进展
- 作用机理：丙型肝炎病毒 NS3 蛋白酶在病毒多蛋白的加工成熟过程中起关键作用，Hepatitis Virus C NS3 Protease Inhibitor 2 通过其特定的氨基酸序列与 NS3 蛋白酶的活性位点或变构位点结合，阻止蛋白酶对病毒多蛋白的切割，从而阻断病毒多蛋白向成熟的非结构蛋白的转化，进而抑制病毒的复制和组装过程。
- 研究进展：研究表明它对丙型肝炎病毒 NS3 蛋白酶具有较好的抑制活性，其 Ki 值为 41nM。在细胞实验和动物模型中能有效抑制丙型肝炎病毒的复制，但目前尚未广泛应用于临床治疗，仍处于研究和开发阶段，进一步的研究正在探索其在不同基因型丙型肝炎病毒中的效果、与其他抗病毒药物的联合应用以及长期使用的安全性和耐药性等问题。
溶解保存
- 溶解：可尝试先用去离子水溶解，若溶解性不佳，可使用二甲基亚砜（DMSO）等有机溶剂辅助溶解，但要注意有机溶剂的残留可能对实验产生影响，需进行适当处理。
- 保存：作为粉末状固体，应在 - 80℃至 - 20℃的干燥环境下保存，避免受潮和氧化。如果是溶解后的溶液，需分装保存，避免反复冻融，在 - 20℃以下保存，并注意溶液的无菌性，可过滤除菌或添加适量防腐剂。
相关多肽
与其他一些 NS3 蛋白酶抑制剂多肽可能存在结构或作用机制上的相似性，如一些同样以作用于 NS3 蛋白酶活性位点为靶点的多肽类抑制剂，可能在氨基酸组成或序列上有部分相同或相似之处，例如一些含有特定疏水氨基酸或能够与 NS3 蛋白酶形成氢键、盐桥等相互作用的氨基酸的多肽。
相关文献
“Inhibition of hepatitis C virus NS3 protease activity by product-based peptides is dependent on helicase domain”，DOI: 10.1016/s0960-894x(00)00625-9
