基本信息
- 英文名称：Garvicin KS、GakB
- 中文名称：Garvicin KS 暂译为加维菌素 KS ，GakB 尚无标准通用中文译名
- 氨基酸序列：GakB 为 MGAI IKAGAKIIGKGL LGGAAGGA TYGGLK KIFG ，Garvicin KS 由 GakA、GakB 和 GakC 三种小肽组成 ，GakA 序列为 MGAI IKAGAKIVGKGVLGGGASWLGWNVGEKIWK ，GakC 序列为 MGAI IKAGAKIVGKALTGGG VWLA EKLFGGK
- 单字母序列： MGAI IKAGAKIIGKGL LGGAAGGA TYGGLK KIFG
- 三字母序列：
- GakB：Met - Gly - Ala - Ile - Ile - Lys - Ala - Gly - Ala - Lys - Ile - Ile - Gly - Lys - Gly - Val - Leu - Gly - Gly - Gly - Ala - Gly - Gly - Ala - Thr - Tyr - Gly - Gly - Lys - Lys - Ile - Phe - Gly
- 分子量：GakB 约 3161.08
- 分子式：GakB 为 C₁₄₅H₂₄₇N₃₉O₃₇S
- CAS 号：2098351 - 25 - 6
- 供应商：上海楚肽生物科技有限公司
结构信息
Garvicin KS 是一种多肽细菌素，由三个大小在 32 - 34 个氨基酸之间的相似小肽构成。GakB 是其中一个 34 氨基酸肽，与 GakA、GakC 通过特定的氨基酸排列顺序和相互作用，形成具有特定空间构象和功能的细菌素结构。这些小肽之间可能通过氢键、疏水相互作用等维持整体结构的稳定性，这种稳定结构对其发挥抗菌等生物学活性至关重要。
作用机理及研究进展
- 作用机理：Garvicin KS 具有抗菌活性，可能通过与敏感菌细胞膜上特定受体结合，在细胞膜上形成孔道，导致细胞内重要物质如离子、氨基酸等外泄，破坏细胞正常生理功能，抑制细菌生长甚至导致细菌死亡。GakB 在其中可能参与 Garvicin KS 的合成、分泌、转运或者作用过程。例如，它可能参与 Garvicin KS 的加工修饰，使其具备活性；或者辅助 Garvicin KS 识别并结合到靶细胞上，增强 Garvicin KS 的抗菌效果。研究发现 GakB 和 GakA 组合具有良好的肽稳定性、抗菌效力，同时还会影响成纤维细胞的活力和增殖 ，对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的抑制效果中，GakB 的最小抑菌浓度（MIC）值相对较低，抑制效果较好。
- 研究进展：目前研究主要集中在 Garvicin KS 的抗菌活性及应用潜力探索，发现它对许多致病性革兰氏阳性细菌，如李斯特菌、肠球菌、芽孢杆菌和葡萄球菌等具有强大活性，在食品保鲜、医疗抗菌等领域展现出潜在应用价值。关于 GakB，研究主要围绕它与 Garvicin KS 其他组分的协同作用及在相关生物学过程中的功能，但具体分子机制仍有待深入研究。
溶解保存
- 粉末保存：应将其置于干燥环境，避免受潮，-20℃条件下可保存 3 年。
- 溶液保存：建议在 - 80℃保存，保存时需注意分装，避免反复冻融。若多肽中含有易氧化的氨基酸，如 Cys（半胱氨酸）、Met（甲硫氨酸）等，应保存在无氧环境中，以维持多肽的稳定性和活性。如果需要溶解，可先尝试用无菌去离子水，若溶解性不佳，也可使用少量二甲基亚砜（DMSO）助溶，但要留意 DMSO 在最终使用浓度下对生物活性的影响。
相关多肽
- Nisin（乳酸链球菌素）：也是一种细菌素，常用于食品保鲜，能抑制革兰氏阳性菌生长，与 Garvicin KS 在抗菌功能上有相似之处，但抗菌谱和作用机制存在差异。
- Enterocin（肠球菌素）：由肠球菌产生的细菌素，有抗菌活性，与 Garvicin KS 同属细菌素类多肽，在结构和功能上或许存在关联和共性，研究它有助于深入理解细菌素的作用机制和应用潜力。
相关文献
- Thapa RK, Winther - Larsen HC, Diep DB, Tønnesen HH. Preformulation studies on novel Garvicin KS peptides for topical applications. European Journal of Pharmaceutical Sciences. 2025; 151: 105333.
- Telke AA, Ovchinnikov KV, Vuori Sto KS, Mathiesen G, Thorstensen T, Diep DB. Over 2000 - fold increased production of the leaderless bacteriocin Garvicin KS by increasing gene dose and optimization of culture conditions. Frontiers in Microbiology. 2019; 10: 389.
- Ovchinnikov KV, Chi H, Mehmeti I, Holo H, Nes IF, Diep DB. Novel group of leaderless multi peptide bacteriocins from gram - positive bacteria. Applied and Environmental Microbiology. 2016; 82(17): 5216 - 24.
