DARTS技术由Lomenick团队于2009年在《美国国家科学院院刊》（PNAS）首次报道。其理论基础源于对生物大分子相互作用的深入观察：当DNA与转录因子结合，或蛋白质与天然配体（如糖类、核酸）相互作用时，其结构稳定性显著增强，表现为对核酸酶或蛋白酶的水解抗性大幅提高。基于这一现象，研究者提出了一个创新性假说：小分子药物与靶蛋白结合后，可能会增强靶蛋白对蛋白酶解的耐受性。
为验证这一假设，研究团队在重组蛋白体系中进行了系统实验。他们以经典的药靶对FKBP12及其抑制剂雷帕霉素/FK506作为模型，发现经药物处理的FKBP12对枯草杆菌蛋白酶的敏感性显著降低（EC50下降约5倍），而无关药物则无此效应。进一步在结合力较弱的E4-mTOR系统中重复实验，仍观察到显著的水解保护现象，从而初步证实了该方法的普适性。
Figure 1 DARTS技术原理示意图A、DARTS技术概念图B、重组人FKBP12蛋白与指定的药物共同孵育后，经枯
Figure 1 DARTS技术原理示意图A、DARTS技术概念图B、重组人FKBP12蛋白与指定的药物共同孵育后，经枯草蛋白酶消化的原理验证C、mTOR激酶抑制剂E4的DARTS实验
在复杂生物体系验证中，研究采用了靶向EF-1α的天然产物didemnin B处理Jurkat细胞。通过SDS-PAGE分析，药物处理组在50 kDa区域出现了明显的保护条带，质谱鉴定确认为EF-1α蛋白。进一步的免疫印迹实验表明，EF-1α的酶解保护效应呈现药物浓度依赖性，为DARTS技术的可行性提供了直接证据。
Figure 2 全细胞裂解液DARTS实验A、完整的Jurkat细胞用DB（1 g/ml）处理，并对裂解液进行嗜热菌蛋白酶消化和考马斯亮蓝染色B、通过质谱分析揭示保护条带中的EF-1蛋白C、通过免疫印迹检测DARTS
基于这些基础研究，研究团队通过多组药靶对验证了该技术的通用性，并成功实现了对药物白藜芦醇分子靶标的筛选。DARTS技术因其操作简便、无需化学修饰等优势，迅速成为药物靶点筛选的重要工具，至今仍被广泛应用于靶标发现研究。
