鹊桥二号中继星已在轨稳定运行14个月。它携带的3台载荷在完成在轨测试后，相继开展了对地球等离子体层和磁层大尺度成像观测、地月系统VLBI（甚长基线干涉测量）试验观测等科学探测，取得了阶段性进展。
在轨运行以来，鹊桥二号中继星搭载的极紫外相机获得了国际首幅83.4纳米波段电离层全景图像；阵列中性原子成像仪获取了高分辨率的磁层能量中性原子图像数据，特别是地球磁层平静期、磁暴期间及亚暴期间的探测数据。
月球轨道VLBI试验系统通过与上海65米天马望远镜等测站开展月地联合观测，首次将物理观测基线延长至38万公里，成功观测射电源A00235、嫦娥六号轨道器等深空目标。
此外，2024年5月至6月，鹊桥二号中继星还为嫦娥六号人类首次月背取样任务提供了稳定可靠的中继通信保障。后续，它还将继续开展科学探测，并为国内外月球探测任务提供中继通信服务。
