PR-39 TFA ;RRPPPPRLPPRPPRLPPRPPRLPPRPPRLPP

一、基本信息

  1. 英文名称:PR-39 TFA,其中 PR-39 为抗菌肽名称,TFA 是三氟乙酸盐(Trifluoroacetate)的缩写。
  2. 中文名称:猪防御素 39 三氟乙酸盐
  3. 氨基酸序列
  • 单字母序列:RRPPPPRLPPRPPRLPPRPPRLPPRPPRLPP
  • 三字母序列:Arg - Arg - Pro - Pro - Pro - Pro - Arg - Leu - Pro - Pro - Arg - Pro - Pro - Arg - Leu - Pro - Pro - Arg - Pro - Pro - Arg - Leu - Pro - Pro - Arg - Pro - Pro - Arg - Leu - Pro - Pro
  1. 分子量:约 1659.92(包含三氟乙酸盐结合后的分子量),多肽部分分子量约 1546.81 。
  2. 分子式:C₆₆H₁₀₇N₂₁O₂₆・C₂HF₃O₂ ,其中 C₆₆H₁₀₇N₂₁O₂₆为多肽部分分子式,C₂HF₃O₂为三氟乙酸分子式 。
  3. 等电点:理论计算约为 12.0 。序列中含有大量带正电的精氨酸(Arg),且无明显带负电的酸性氨基酸,使得等电点呈强碱性 。
  4. CAS 号:目前未检索到 PR-39 TFA 相关 CAS 登记号 。
  5. 供应商:上海楚肽生物科技有限公司

二、结构信息

PR-39 TFA 由 39 个氨基酸组成线性多肽链,其结构具有显著特点。序列中富含脯氨酸(Pro)和精氨酸(Arg),脯氨酸占比高达 74.4% 。脯氨酸的特殊亚氨基酸结构,导致肽链难以形成常规的 α - 螺旋和 β - 折叠结构,而是呈现出一种高度伸展的、类似 “绳状” 的构象 。精氨酸均匀分布在肽链中,赋予多肽强正电荷特性 。这种结构使得 PR-39 TFA 在溶液中能够保持相对稳定的伸展状态,有利于其与带负电荷的细菌细胞膜相互作用 。三氟乙酸盐(TFA)通常与多肽中的碱性基团(如精氨酸的氨基)结合,影响多肽在溶液中的溶解性、稳定性和聚集状态 。

三、作用机理及研究进展

  1. 作用机理:PR-39 TFA 是一种抗菌肽,主要通过破坏细菌细胞膜发挥抗菌作用 。细菌细胞膜表面通常带有负电荷,而 PR-39 TFA 因富含精氨酸带有大量正电荷,二者通过静电相互作用,使 PR-39 TFA 吸附在细菌细胞膜表面 。随后,PR-39 TFA 的疏水性区域插入细胞膜的脂质双分子层中,破坏细胞膜的完整性,形成跨膜通道,导致细胞内物质外流,最终使细菌死亡 。此外,PR-39 TFA 还可能进入细菌细胞内,与细胞内的核酸、酶等生物大分子相互作用,干扰细菌的正常生理代谢过程,进一步抑制细菌生长 。在动物体内,PR-39 TFA 不仅具有抗菌活性,还能调节免疫反应,如促进炎症细胞的趋化、调节细胞因子的分泌等,有助于机体抵抗感染 。
  2. 研究进展:在抗菌活性研究方面,大量实验表明 PR-39 TFA 对革兰氏阴性菌(如大肠杆菌、铜绿假单胞菌)和革兰氏阳性菌(如金黄色葡萄球菌)均具有较强的抑菌效果 。其最低抑菌浓度(MIC)在 4 - 32 μg/mL 范围内 。在耐药菌研究领域,与传统抗生素不同,PR-39 TFA 不易诱导细菌产生耐药性,多次传代实验中,细菌对其敏感性未出现明显下降 ,这使其在应对耐药菌感染方面具有潜在优势 。在生物医学应用研究中,科学家尝试将 PR-39 TFA 用于创伤感染治疗、局部抗菌涂层开发等领域 。例如,在创伤敷料中添加 PR-39 TFA,可有效抑制伤口感染,促进伤口愈合 。此外,通过对 PR-39 TFA 的结构改造和修饰,开发出了一系列活性更高、稳定性更好的类似物,进一步拓展了其应用前景 。

四、溶解保存

  1. 溶解:PR-39 TFA 可先尝试用水溶解 。鉴于其含有大量带正电氨基酸,在水中溶解性较好 。若溶解性不佳,可尝试使用 10% - 30% 的乙酸溶液溶解;一般情况下无需使用二甲基亚砜(DMSO)辅助溶解 。溶解过程中应避免剧烈搅拌和高温,防止多肽降解或聚集 。实验前建议进行预实验,以确定最佳的溶解条件 。
  2. 保存
  • 粉末状态:建议保存在 - 20 ± 5 °C 的低温环境下,在此条件下其稳定性较好,可保存数年 。需避免保存在温度波动较大的环境中,以防多肽降解 。
  • 溶液状态:若配制成溶液,应尽量分装保存,以减少反复冻融对其活性的影响 。在 - 80 °C 的超低温环境下,可保存数月;在 - 20 °C 环境下,保存时间相对较短,大概 1 - 2 个月 。溶液中的 PR-39 TFA 可能会随着时间发生降解、聚集等变化,尤其是在温度较高或溶液 pH 不合适等情况下,因此严格控制保存条件十分关键 。

五、相关多肽

  1. LL-37:一种人类内源性抗菌肽,同样具有抗菌和免疫调节功能 。与 PR-39 TFA 相比,LL-37 的氨基酸组成和序列不同,LL-37 能够形成 α - 螺旋结构,而 PR-39 TFA 呈伸展构象 。二者在抗菌谱和免疫调节机制上也存在一定差异 。
  2. Cecropins:一类昆虫来源的抗菌肽,通过破坏细菌细胞膜发挥抗菌作用 。Cecropins 的结构通常为两亲性 α - 螺旋,与 PR-39 TFA 的绳状结构不同 ,但二者在抗菌的初始作用方式(与细胞膜相互作用)上有相似之处 。
  3. Magainin 2:来源于非洲爪蟾皮肤的抗菌肽,其作用机制也是破坏细菌细胞膜 。Magainin 2 具有 α - 螺旋结构,与 PR-39 TFA 在结构和作用细节上存在差异,对比研究有助于理解不同结构抗菌肽的构效关系 。

六、相关文献

  1. Zasloff, M. (2002). Antimicrobial peptides of multicellular organisms. Nature, 415(6870), 389 - 395.
  2. Gennaro, R., & Salomón, D. (2011). Antimicrobial peptides: old molecules with new ideas. Cellular and Molecular Life Sciences, 68(4), 629 - 646.
  3. Hancock, R. E. W., & Sahl, H. - G. (2006). Antimicrobial and host - defense peptides as new anti - infectious agents. Nature Biotechnology, 24(12), 1551 - 1557.

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