PP18 ;H₂N - Pro - Pro - Leu - Lys - Arg - Asp - Ser - Gly - Pro - Thr - Tyr - Val - Ile - Phe - Glu - Lys - COOH

PP18 ;H₂N - Pro - Pro - Leu - Lys - Arg - Asp - Ser - Gly - Pro - Thr - Tyr - Val - Ile - Phe - Glu - Lys - COOH

一、基本信息

  1. 英文名称:PP18
  2. 中文名称:暂译为 “PP18 肽”
  3. 氨基酸序列:假设其为具有生物活性的功能性短肽,序列如下:
  • 单字母序列:H₂N - Pro - Pro - Leu - Lys - Arg - Asp - Ser - Gly - Pro - Thr - Tyr - Val - Ile - Phe - Glu - Lys - COOH
  • 三字母序列:H₂N - Pro - Pro - Leu - Lys - Arg - Asp - Ser - Gly - Pro - Thr - Tyr - Val - Ile - Phe - Glu - Lys - COOH
  1. 分子量:约 1840.1(根据假设序列计算,实际分子量依准确序列而定)
  2. 分子式:C₈₀H₁₂₉N₂₁O₂₆(假设序列对应的分子式,具体需依据实际序列确定)
  3. 等电点:理论估算约为 9.2 - 9.8 。因序列中含有带正电的精氨酸(Arg)、赖氨酸(Lys)和带负电的天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu),但正电氨基酸数量多于负电氨基酸,使得等电点偏碱性 。
  4. CAS 号:目前未检索到 PP18 相关 CAS 登记号 。
  5. 供应商:上海楚肽生物科技有限公司

二、结构信息

PP18 由 16 个氨基酸组成线性多肽链,两端分别为氨基和羧基。序列中脯氨酸(Pro)含量较高,因其特殊的亚氨基酸结构,易造成肽链的转折,可能形成多个 β - 转角结构,影响多肽的整体构象 。精氨酸(Arg)和赖氨酸(Lys)带有正电荷,天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)带负电,这些带电氨基酸可通过静电相互作用与带相反电荷的生物分子结合 。丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)的侧链含有羟基,可能参与氢键的形成,影响分子间的相互作用 。亮氨酸(Leu)、缬氨酸(Val)、异亮氨酸(Ile)和苯丙氨酸(Phe)等疏水性氨基酸,使多肽具有一定的疏水性,有助于其与疏水性靶标结合 。从二级结构预测来看,该序列可能形成局部的 β - 折叠或无规卷曲结构 。

三、作用机理及研究进展

  1. 作用机理:由于缺乏关于 PP18 的公开研究报道,基于假设序列推测其可能的作用机理 。其一,脯氨酸形成的 β - 转角结构可能使多肽呈现特定的空间构象,使其能够契合靶蛋白的活性位点或别构位点,进而调节靶蛋白的功能 。其二,带电氨基酸介导的静电相互作用,可使 PP18 与细胞膜表面或细胞内带相反电荷的生物分子结合,参与信号传导或物质运输过程 。若 PP18 是细胞穿透肽,精氨酸和赖氨酸等正电荷氨基酸可与细胞膜表面带负电的磷脂头部相互作用,辅助其跨膜运输 。此外,若多肽中某些氨基酸残基处于特定空间位置,可能作为酶的底物被修饰(如磷酸化、糖基化等),进而激活或抑制相关信号通路 。
  2. 研究进展:目前未检索到关于 PP18 的研究进展报道 。参考类似氨基酸组成的多肽研究方向,未来对其研究可能集中在以下领域 。在『肿瘤』研究中,可探索其是否能作为『肿瘤』细胞表面受体的配体,用于『肿瘤』靶向诊断或治疗;在神经退行性疾病研究中,某些具有特定氨基酸序列的多肽可与异常聚集的蛋白相互作用,抑制蛋白聚集,PP18 或可用于研究相关蛋白的病理机制 。在药物递送领域,其疏水性和电荷特性可能使其成为潜在的细胞穿透肽或纳米颗粒表面修饰肽,用于改善药物的递送效率 。

四、溶解保存

  1. 溶解:PP18 可先尝试用水溶解 。鉴于其含有较多疏水性氨基酸和带电氨基酸,若在水中溶解性不佳,可尝试使用 10% - 30% 的乙酸溶液溶解;若仍不溶解,可使用少量二甲基亚砜(DMSO)辅助溶解 。在使用 DMSO 溶解时,需注意其使用浓度,避免对后续实验产生影响 。实验前建议进行预实验,确定最佳的溶剂及溶解条件 。
  2. 保存
  • 粉末状态:建议保存在 - 20 ± 5 °C 的低温环境下,在此条件下其稳定性较好,可保存数年 。需避免保存在温度波动较大的环境中,以防多肽降解 。
  • 溶液状态:若配制成溶液,应尽量分装保存,以减少反复冻融对其活性的影响 。在 - 80 °C 的超低温环境下,可保存数月;在 - 20 °C 环境下,保存时间相对较短,大概 1 - 2 个月 。溶液中的 PP18 可能会随着时间发生降解、聚集等变化,尤其是在温度较高或溶液 pH 不合适等情况下,因此严格控制保存条件十分关键 。

五、相关多肽

  1. 细胞穿透肽 TAT:经典的细胞穿透肽,氨基酸序列为 YGRKKRRQRRR,富含精氨酸,能够携带生物分子跨膜 。与 PP18 相比,TAT 肽的精氨酸含量更高,细胞穿透能力更强,而 PP18 的脯氨酸含量较高,结构上存在差异 。
  2. 抗菌肽 LL - 37:氨基酸序列为 KSLKKTETQLEKQAKKLKKIGQKFLVCRLFKKLKTDELRQWLHD ,含有多种带电氨基酸和疏水性氨基酸,通过破坏细菌细胞膜发挥抗菌作用 。虽然与 PP18 都包含多种氨基酸类型,但序列组成和排列不同,功能也可能不同 。
  3. 淀粉样蛋白 β(Aβ)片段:如 Aβ₁ - 4₂(DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA),在神经退行性疾病中,Aβ 片段的异常聚集与疾病发生发展相关 。PP18 若含有与 Aβ 片段相似的疏水性结构或特定氨基酸序列,可能在蛋白聚集研究中具有参考价值 。

六、相关文献

由于暂无 PP18 相关文献,可参考以下类似研究方向的文献:

  1. Vives, E., Brodin, P., & Lebleu, B. (1997). A truncated HIV - 1 Tat protein basic domain rapidly translocates through the plasma membrane and accumulates in the cell nucleus. The Journal of Biological Chemistry, 272 (25), 16010 - 16017.(细胞穿透肽 TAT 相关研究)
  2. Zasloff, M. (2002). Antimicrobial peptides of multicellular organisms. Nature, 415 (6870), 389 - 395.(抗菌肽相关综述)
  3. Hardy, J., & Selkoe, D. J. (2002). The amyloid hypothesis of Alzheimer's disease: progress and problems on the road to therapeutics. Science, 297 (5580), 353 - 356.(淀粉样蛋白 β 与阿尔茨海默病相关研究)

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