VMD 是 Visual Molecular Dynamics的缩写,它是一款功能强大的开源分子可视化程序,用于化学绘图和分子运动分析,专为建模,可视化和分析生物系统而设计,同时也支持有机分子轨道和电子分布的作图。
VMD最大的优势就是简单和灵活,提供出色的绘图功能和操作简单,便捷快速,安装简单,非常易于使用。如果你没有任何分子建模的经验,建议从VMD入手,至少可视化的操作和友好的界面不会打击你建模的耐心。
VMD的作图能力非常优秀,操作简单,方便快捷,经常用来制作期刊封面、文章示意图等,下面的Nature、Science封面就用VMD绘制的。
本文包括专为新手制作的一套VMD课程,共30节,外加美国阿贡国家实验室VMD培训课程和课件,课程是英文,但发音清晰对初学者友好。
部分课件PPT展示