基本信息:
- 英文名称:Ala-Ala-Phe-chloromethylketone TFA,也可写作 H-Ala-Ala-Phe-CMK・CF3CO2H 等18。
- 中文名称:暂无统一规范中文名称,可译为丙氨酰 - 丙氨酰 - 苯丙氨酰氯甲基酮三氟乙酸盐。
- 氨基酸序列:丙氨酸 - 丙氨酸 - 苯丙氨酸。
- 单字母序列:AAF。
- 三字母序列:Ala-Ala-Phe。
- 分子量:339.81700(以 C₁₆H₂₂ClN₃O₃计算)。
- 分子式:C₁₆H₂₂ClN₃O₃。
- CAS 号:102129-66-8。
- 结构图:
AAF-CMK 结构图
AAF-CMK 3D结构图
- 结构信息:是一种含有氯甲基酮基团的多肽,其结构中包含丙氨酸 - 丙氨酸 - 苯丙氨酸序列,末端的苯丙氨酸与氯甲基酮相连,整体为线性多肽结构,分子中存在肽键和氯甲基酮官能团等,具有一定的空间构型,能够与靶酶特异性结合。
- 作用机理:AAF-CMK 是三肽基肽酶 II(TPPII)的不可逆抑制剂,通过其独特的化学结构,与 TPPII 的活性位点不可逆地结合,抑制 TPPII 的活性。TPPII 是一种参与蛋白质后翻译修饰和降解的大型蛋白酶,AAF-CMK 抑制 TPPII 后,会影响蛋白质的降解途径,进而干扰肿瘤细胞的蛋白质稳态和生存机制,最终诱导细胞凋亡。
- 研究进展:研究发现 AAF-CMK 对白血病 U937 细胞具有细胞毒性,可通过内源性途径诱导细胞凋亡,还能引起自噬和蛋白质聚集。实验中观察到处理组细胞中半胱天冬酶 9 和 3 被激活,使用半胱天冬酶抑制剂 zVDA 可恢复细胞活力。同时,通过透射电子显微镜观察到细胞出现凋亡和自噬的超微结构特征,还发现了两种类型的蛋白质聚集体。
- 溶解保存:可尝试溶解在有机溶剂如 DMSO 中。粉末状态下,-20°C 可保存 3 年,4°C 可保存 2 年;溶解在溶剂中时,-80°C 可保存 6 个月,-20°C 可保存 1 个月,需密封储存,避免光照和水分影响。
- 相关多肽:相关多肽如 Ac-Tyr-Val-Ala-Asp-chloromethylketone,是 caspase-1 的细胞可透性不可逆抑制剂;Ac-Asp-Glu-Val-Asp-chloromethylketone,可不可逆地抑制 caspase-3,也对 caspase-6、-7、-8 和 - 10 有活性等,它们都属于氯甲基酮类多肽,c 端经氯甲基酮修饰,可用于酶活性研究等。
相关文献:
- Glas R, Bogyo M, McMaster JS, Gaczynska M, Ploegh HL. A new inhibitor reveals an essential role for tripeptidyl peptidase II in MHC class I antigen processing. Nature. 1998 Mar 26;392(6674):618-22.
- Geier E, Pfeifer G, Wilm M, Lucchiari-Hartz M, Baurmeister W, Eichmann K, Niedermann G. A proteasome-independent pathway for the generation of MHC class I ligands. Science. 1999 Feb 12;283(5404):978-81.
- Johnson LA, Moon KE, Eisenberg M. Interaction of chymotrypsin with a new class of irreversible inhibitors containing a chloromethyl ketone group. Biochemistry. 1988 Jun 28;27(13):4709-15.