自建站虽然前期成本相对较高，需要投入资金购买服务器、域名，聘请专业的开发团队进行网站建设开发。但从长远来看，一旦网站搭建完成，后续的维护和升级成本相对可控。而且，自建站可以根据自身需求灵活调整资源，避免了模板建站可能出现的频繁额外收费问题。例如，一家小型电商企业，选择模板建站初期花费较少，但随着业务增长，为了满足更多用户同时在线购物和复杂订单处理的需求，不断升级模板功能，最终累计花费远超自建站成本。
模板建站提供的是通用型模板，功能相对固定。虽然部分平台声称可以定制，但定制程度有限。对于一些业务模式独特、有特殊功能需求的企业来说，模板建站很难满足其个性化要求。比如，一家提供在线教育服务的企业，需要实现直播授课、在线考试、学习进度跟踪等复杂功能，模板建站可能无法提供完善的解决方案，或者需要借助多个第三方插件，这不仅影响网站稳定性，还可能增加运营成本。
自建站则具有高度的灵活性，数字化网站建设过程中，开发团队可以根据企业的业务流程和功能需求，量身定制网站。从用户界面设计到后台管理系统开发，都能紧密贴合企业实际，确保网站功能与企业业务完美适配。例如，一家制造业企业通过自建站，实现了产品定制化展示、在线询价、生产进度查询等特色功能，大大提升了客户体验和企业运营效率。
在数字化时代，数据是企业的重要资产。模板建站中，网站数据通常存储在平台服务器上，企业对其数据的控制权有限。一旦平台出现安全问题或经营不善，企业的数据可能面临泄露、丢失风险。而且，部分模板建站平台在服务条款中规定，对企业数据拥有一定使用权，这可能给企业带来潜在风险。
自建站则不同，企业拥有网站数据的完全所有权和控制权。通过选择可靠的服务器和专业的安全防护措施，企业可以有效保障数据安全。同时，自建站可以根据自身安全策略，对数据进行备份、加密等处理，确保数据在任何情况下都能得到妥善保护。例如，一家金融机构通过自建站，建立了严格的数据安全管理体系，保障了客户资金信息和交易数据的安全。
