第一步,锁定KEAP1为直接作用靶点
探针设计:合成生物素标记冬凌草乙素(图1a)
靶点捕获:Pull-down实验显示70 kDa特异性条带(图1b-c),质谱鉴定:KEAP1(69 kDa)为高置信结合蛋白(质谱数据图1d)。
第二步,揭示KEAP1-PGAM5调控轴
互作蛋白挖掘:
文献与质谱数据交叉验证发现 PGAM5 为KEAP1关键互作蛋白
Pull-down证实冬凌草乙素可捕获KEAP1-PGAM5复合物(图1e)
生物学意义:
KEAP1通过调控PGAM5影响线粒体凋亡通路,与肝癌进展密切关联
第三步,双维度验证作用机制
结合特异性验证:HuProt™ 蛋白芯片筛选:鉴定662个潜在结合蛋白,KEAP1结合亲和力显著(ΔRFU>85%),PGAM5无直接结合(图1g-h)
功能依赖性实验
KEAP1敲低:MMP9蛋白表达显著降低
KEAP1敲低+冬凌草乙素:药物效应消失(MMP9无显著变化)→ 证明药理作用完全依赖KEAP1(图1i)
图1
更多详细内容可查看我们的软文分享:【《Adv Sci》解读:HuProt™蛋白芯片筛选抗癌化合物结合蛋白!冬凌草乙素稳定KEAP1-PGAM5抑制肝癌进展】
本文冬凌草乙素小分子筛选蛋白组芯片技术,由广州基云提供支持。
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