N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite 是一种广泛应用于核酸化学和生物分析领域的功能性试剂,属于氨基修饰的磷酰胺化试剂(Amidite)。它的化学全名为 N-[4-(4-二甲氨基苯基)偶氮苯基]-6-氨基己基磷酰胺(N-[4-(4-dimethylaminophenyl)azo]phenyl-6-aminohexyl phosphoramidite),常用于寡核苷酸(oligonucleotide)合成过程中作为荧光淬灭剂的引入单元。其独特的结构和化学性质使其在荧光探针设计、分子标记以及FRET(Förster Resonance Energy Transfer,福斯特共振能量转移)体系中发挥重要作用。
从化学结构上看,N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite 包含三个关键部分:
- DABCYL 荧光淬灭基团:DABCYL(4-(4-二甲氨基苯基)偶氮苯基)是一种强效的非荧光淬灭剂,能够通过能量转移或光化学淬灭机制抑制邻近荧光分子的发光。
- 6-氨基己基链(6-Aminohexyl linker):该柔性碳链作为连接桥,将DABCYL基团与目标寡核苷酸或分子结合,提供空间上的灵活性,从而减少对目标分子天然结构的干扰。
- 磷酰胺(Amidite)活性基团:Amidite 是寡核苷酸合成中常用的反应活性基团,通过固相合成策略可以高效地引入到DNA🧬或RNA链的特定位点,保证修饰的准确性和稳定性。
名称:N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
保存:冷藏
供应:西安齐岳生物科技有限公司
在实验应用方面,N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite 主要用于合成具有荧光淬灭功能的寡核苷酸探针。例如,在 FRET 探针设计中,DABCYL 通常作为能量受体(quencher),与荧光供体分子形成配对体系。当寡核苷酸探针处于未结合状态时,DABCYL 可以有效淬灭荧光供体的发光信号;而当探针与靶序列结合形成双链结构时,供体与受体间的距离发生变化,导致荧光信号增强,从而实现对特定核酸序列的检测和定量。此类探针广泛应用于实时定量PCR(qPCR)、分子成像、核酸检测和生物传感器开发等领域。
N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite 的使用还具有如下优势:
- 高反应特异性:Amidite 功能团与寡核苷酸 5’ 端或特定位点的羟基高效反应,形成稳定的磷酸酯键。
- 化学稳定性:DABCYL 荧光淬灭基团在常规的寡核苷酸合成和去保护条件下保持化学稳定,不易降解。
- 空间灵活性:6-氨基己基链的存在提供了适度的空间距离,使荧光信号调控更灵敏,减少分子间干扰。
在实验操作中,N-DABCYL-6-Aminohexyl Amidite 通常溶于无水的有机溶剂,如乙腈(acetonitrile),并在干燥、避光条件下保存。由于其高度反应性,使用时需注意避免与水分接触,以防止水解失活。此外,作为氨基修饰型的 Amidite,它需要通过标准的固相寡核苷酸合成仪进行自动化合成,通常在合成完成后进行去保护和纯化,得到高纯度的 DABCYL 标记寡核苷酸。
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