AF647 NHS ester (6C-Linker);407627-60-5; AF系列荧光染料

AF647-NHS ester 是 Alexa Fluor 647 (AF647) 的类似物。NHS ester 能够与带有氨基的分子 (如蛋白质、抗体等) 发生共价结合。AF647 是一种远红光荧光染料。

一、基本信息
  • 英文名称:AF647 NHS ester (6C-Linker)、Alexa Fluor 647 NHS ester (6-carbon linker)
  • 中文名称:AF647 琥珀酰亚胺酯(6 碳连接臂)
  • CAS 号:407627-60-5
  • 分子式:C₄₀H₄₉N₃O₁₆S₄
  • 分子量:956.09
  • 结构图

二、关键光学性能

荧光波段为远红光区,与 AF647 系列通用光学参数匹配,最大激发波长(Ex)≈650 nm,最大发射波长(Em)≈665 nm,精准适配流式细胞仪、激光共聚焦显微镜🔬、荧光显微镜🔬的远红光 / 红色检测通道;可与 AF488、AF555 等绿色、橙色荧光染料搭配实现多色荧光标记,信号无交叉干扰,背景低、信噪比高。

核心光学优势:荧光亮度高,摩尔消光系数优异;光稳定性突出,抗光漂白能力强,适合长时间连续荧光成像与检测;荧光信号在 pH 4.0-10.0 范围内无显著淬灭,适配细胞裂解液、血清、组织切片等复杂生物样本,标记后荧光性能无衰减。

三、溶解性与保存条件

溶解性:易溶于 DMSO、DMF 等有机溶剂,可在低比例有机相的 PBS/HEPES 缓冲液中稳定分散,标记实验建议用无水 DMSO 配制 10 mM 母液,再按实验需求稀释至工作浓度,无需高比例有机相助溶,适配生物体系温和反应。

保存条件:粉末状态需 - 20℃干燥避光密封保存,加入硅胶干燥剂,避免反复冻融、高温与潮湿环境,真空密封状态下有效期 24 个月;DMSO 母液需小体积分装避光冻存,有效期 6 个月,实验时现配现用,避免母液反复冻融导致活性基团失效。

四、结构与反应特性
  • 结构核心:以 Alexa Fluor 647 经典远红光荧光母核为基础,末端通过6 碳柔性连接臂连接 NHS ester 活性基团;6 碳连接臂为柔性直链结构,相比短链连接臂,能有效减少荧光基团与目标分子之间的空间位阻,降低对目标分子构象的影响,同时提升染料在水相反应体系中的分散性,避免荧光基团聚集淬灭;NHS ester 为伯胺特异性活性位点,无额外非特异性结合位点。
  • 靶向反应特性:NHS ester 活性基团可特异性与蛋白、多肽、核酸等生物分子上的伯胺基团(如赖氨酸残基、N 端氨基、人工修饰氨基位点)发生酰胺化反应,形成稳定不可逆的共价酰胺键,对巯基、羧基等其他基团无交叉反应,标记特异性高。
  • 偶联实验条件:最佳反应体系为 pH 7.0-8.5 的 PBS/HEPES 缓冲液,室温避光反应 30-60min 即可实现高效偶联;染料与目标分子的摩尔比建议控制在 5:1~20:1,可根据目标分子的伯胺数量灵活调整;反应体系中需避免含 Tris、甘氨酸等游离胺类物质,防止其与活性基团竞争结合,降低标记效率。
五、核心应用场景
  • 常规生物大分子标记:用于抗体、抗原、多肽、酶、核酸等生物大分子的特异性荧光标记,是免疫荧光染色、免疫组化、荧光原位杂交等实验的基础试剂,标记后不影响目标分子的天然结合活性。
  • 流式细胞分析:标记流式抗体,用于细胞分选、细胞表型分析、细胞凋亡检测、细胞周期分析等流式细胞术实验,标记效率高,荧光信号稳定,检测结果准确性强。
  • 荧光成像研究:标记靶蛋白探针,用于细胞免疫荧光成像、组织切片荧光成像、激光共聚焦显微镜🔬下的蛋白亚细胞定位追踪,适配体外细胞实验与离体组织检测。
  • 生物探针与纳米材料修饰:标记含伯胺的靶向探针、纳米颗粒、脂质体等,赋予其远红光荧光示踪功能,适用于药物递送体系示踪、纳米材料体内外分布研究。
六、其它

[楚肽生物提供多种 Alexa Fluor 系列荧光染料及其修饰服务,服务范围包括:抗体荧光标记、多肽荧光标记、小分子荧光标记、蛋白荧光标记、糖类及其透明质酸类荧光等修饰服务。]

  • AF647-NHS ester (5C-Linker);1620475-28-6
  • AF647 carboxylic acid,tris(triethylammonium) salts;2090339-69-6
  • AF647 C2 maleimide;1825332-75-9
  • AF647 NHS ester,tris(triethylammonium) salts;407627-61-6
  • AF647 carboxylic acid;407627-58-1
  • AF488 carboxylic acid;
  • AF488 NHS ester,single 5 isomer;1374019-99-4
  • AF488 NHS ester,mixture of 5/6 isomers;222164-96-7
  • AF555 carboxylic acid;407627-66-1
  • AF555 carboxylic acid, Tris(triethylammonium)salts;407627-67-2
  • AF555 NHS ester;407627-68-3
  • AF555 NHS ester,TEA salt;407627-69-4
  • AF350 COOH;
  • AF350 NHS ester;200554-19-4
  • AF430 carboxylic acid,TEA salt;780740-46-7
  • AF430 NHS ester;467233-93-8
  • AF430 NHS ester,TEA salt;467233-94-9
  • AF532 NHS ester;477876-64-5
  • AF568 carboxylic acid;
  • AF568 NHS ester,Mixture of 5/6 isomers;247145-38-6

【仅供科研专用,不得用作人体】

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