单纯性甲状腺肿治疗后通常会消退，效果取决于病因、治疗方法和个人差异。该病多因碘缺乏或甲状腺激素合成障碍引起，常见治疗方法包括补充碘剂、甲状腺激素替代疗法以及手术切除。
对于由碘缺乏引起的甲状腺肿，通过摄入加碘盐、海带等富含碘的食物，或者按照医生指导服用碘化钾片，大多数患者在3到6个月内可以看到腺体体积缩小。青少年由于新陈代谢较快，恢复速度可能更快。如果甲状腺肿伴随有甲状腺功能减退，则适合采用甲状腺激素替代治疗，如左甲状腺素钠片等药物，需长期维持以稳定激素水平，腺体一般会在1至2年后显著缩小。
当疾病持续时间较长或形成结节时，腺体组织可能发生纤维化，此时完全恢复正常的可能性降低。若巨大甲状腺肿压迫气管或存在恶性变化的风险，则需要进行手术切除。术后应注意定期检查甲状腺功能，因为残留的腺体可能会出现代偿性增长。先天性甲状腺激素合成酶缺陷者则需终生服药来控制腺体增大。
治疗过程中建议每3至6个月复查一次甲状腺超声和功能状态，保持均衡饮食避免过量或不足的碘摄入。适量运动有助于促进新陈代谢，但应避免颈部剧烈活动以免影响康复。一旦发现声音嘶哑或吞咽困难等症状，应及时就医。日常生活中可以增加硒元素的摄取，比如食用巴西坚果和牡蛎，这有助于维护甲状腺的抗氧化能力。
