D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro ;D-L-P-Rh110-D-P

D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro ;D-L-P-Rh110-D-P

一、基本信息

  • 英文名称:D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro
  • 中文名称:D - 亮氨酰 - 脯氨酰 - 精氨酰 - 罗丹明 110-D - 脯氨酸(依据英文名称和氨基酸命名规则翻译)
  • 氨基酸序列:D-Leu-Pro-Arg-D-Pro,中间连接有荧光标记物罗丹明 110(Rh110)。
  • 单字母序列:D-L-P-Rh110-D-P
  • 三字母序列:D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro
  • 分子量:由于包含特殊的荧光标记罗丹明 110,精确分子量需通过专业质谱分析确定。大致估算,不考虑修饰的情况下,D-Leu、Pro、Arg、D-Pro 的分子量之和约为 475 左右 ,加上罗丹明 110 的分子量(约 478.47),整体分子量预计在 950 以上(具体数值受修饰位点和修饰方式影响 )。
  • 分子式:因结构中包含氨基酸与荧光标记物,具体分子式需借助高分辨质谱、核磁共振等技术结合确定。氨基酸部分元素主要包含 C、H、O、N ,罗丹明 110 含有 C、H、O、N、Cl 等元素。
  • 等电点:由于精氨酸(Arg)的胍基呈碱性,整体多肽的等电点会偏向碱性,但具体数值受罗丹明 110 的影响,在缺乏更多结构信息时难以准确计算,可通过等电聚焦实验测定 。
  • CAS:暂未检索到公开的 CAS 编号,可在专业化学数据库如 SciFinder 中进一步检索。

二、结构信息

从氨基酸序列看,它由五个氨基酸通过肽键依次连接而成,两端为 D 型氨基酸。D 型氨基酸与常见的 L 型氨基酸在空间构型上互为镜像,可能影响多肽的空间折叠和相互作用。中间的罗丹明 110 是一种荧光染料,通过特定的化学键与氨基酸相连,其刚性的平面结构和共轭体系不仅赋予了整个分子荧光特性,还会对多肽的构象产生影响 。整体上,多肽链会由于氨基酸侧链的相互作用形成一定的二级结构,如 β- 转角等,而罗丹明 110 的存在会进一步限制或改变多肽的三维构象。供应商:上海楚肽生物科技有限公司。

三、作用机理及研究进展

  • 作用机理:D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro 中的精氨酸(Arg)残基具有较强的阳离子特性,可能与带负电的生物分子(如核酸、某些蛋白质表面的酸性区域)发生静电相互作用 。而罗丹明 110 作为荧光标记,可用于追踪和检测该多肽在生物体系中的位置和浓度变化。例如,在细胞实验中,它可能被细胞摄取,通过检测荧光强度和分布,可了解其在细胞内的运输途径、代谢情况等。在酶活性检测方面,若该多肽是某种酶的底物,酶对其切割会导致荧光信号变化,从而用于监测酶的活性。
  • 研究进展:目前相关研究主要集中在利用其荧光特性进行生物分子检测和细胞成像领域。一些研究探索了它在检测特定蛋白酶活性方面的应用,通过优化多肽序列和荧光标记条件,提高检测的灵敏度和特异性 。在细胞成像方面,研究人员尝试将其用于活细胞内生物过程的可视化研究,如细胞内蛋白质 - 蛋白质相互作用的监测,但目前研究仍处于初步阶段,还需要进一步优化实验条件和拓展应用范围。

四、溶解保存

  • 溶解:可尝试使用极性溶剂进行溶解,如蒸馏水适用于溶解亲水性较好的多肽;磷酸盐缓冲液(PBS)能维持稳定的 pH 环境,适合对 pH 敏感的体系;二甲基亚砜(DMSO)是一种强极性有机溶剂,对于难溶性的多肽有较好的溶解效果。由于含有荧光标记,在溶解过程中需注意避免强光照射,防止荧光淬灭。
  • 保存:粉末状态下,应保存在低温(-20°C)、干燥、避光的环境中,以防止多肽降解和荧光标记的氧化。溶解后的溶液稳定性降低,建议在 - 80°C 保存,且需密封保存,防止微生物污染和溶液挥发。定期检查溶液的荧光强度和多肽的完整性,以确保其有效性。

五、相关多肽

一些含有精氨酸且用于生物分子检测和成像的多肽与 D-Leu-Pro-Arg-Rh110-D-Pro 具有相关性 。例如,一些基于精氨酸 - 甘氨酸 - 天冬氨酸(RGD)序列的多肽,同样利用氨基酸与生物分子的相互作用,结合荧光标记用于细胞黏附、肿瘤靶向成像等研究,在作用机制和应用方向上有一定的相似性。

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