NBD-Arg-Pro-Lys-Pro-Leu-Ala-Nva-Trp-Lys-(DMC)-NH₂，945414 - 97 - 1#科技#基团#荧光#序列#相互作用#过程

基本信息

英文名称：NBD-Arg-Pro-Lys-Pro-Leu-Ala-Nva-Trp-Lys-(DMC)-NH₂
中文名称：目前无广泛通用的特定中文名称，常以英文名称表述
氨基酸序列：NBD - 精氨酸 - 脯氨酸 - 赖氨酸 - 脯氨酸 - 亮氨酸 - 丙氨酸 - 正缬氨酸 - 色氨酸 - 赖氨酸 -(DMC)- 酰胺
单字母序列：{NBD}-RPKPLA-Nva-W-Lys(DMC)-NH₂
三字母序列：{NBD}-Arg-Pro-Lys-Pro-Leu-Ala-Nva-Trp-Lys(DMC)-NH₂
分子量：1598.85
分子式：C₇₈H₁₁₁N₂₁O₁₆
等电点：因缺乏具体的酸碱解离常数等数据，难以精确计算。但从氨基酸组成看，含有精氨酸、赖氨酸等带正电氨基酸，推测等电点偏碱性。
CAS 号：945414 - 97 - 1

结构信息

该多肽由多个氨基酸残基通过肽键连接而成。NBD（7 - 硝基苯并 - 2 - 氧杂 - 1,3 - 二唑）作为荧光基团连接在多肽 N 端，赋予其荧光特性，可用于检测相关反应。精氨酸、赖氨酸等碱性氨基酸残基带有正电荷，可能参与静电相互作用；脯氨酸具有特殊的环状结构，对多肽的二级结构如 α- 螺旋、β- 折叠的形成和稳定性有重要影响；亮氨酸、丙氨酸、正缬氨酸等具有疏水侧链，可能通过疏水作用影响多肽的空间构象和与其他分子的相互作用；色氨酸含有较大的吲哚环，不仅增加了分子的疏水性，其独特的结构也可能参与 π-π 堆积等特殊相互作用。而 DMC（2,4 - 二甲基环己酮）连接在 C 端赖氨酸上，可能影响多肽整体的空间位阻和化学性质。

作用机理及研究进展

作用机理：NBD-Arg-Pro-Lys-Pro-Leu-Ala-Nva-Trp-Lys-(DMC)-NH₂是基质金属蛋白酶溶质素（MMP-3）水解的底物。MMP-3 属于锌内肽酶家族，能够特异性识别并作用于该多肽的特定肽键。当 MMP-3 与底物结合后，其活性中心的锌离子参与催化肽键水解过程，导致多肽断裂。由于 NBD 荧光基团的存在，在 MMP-3 水解底物前后，体系的荧光性质会发生变化，可在 abs/em=350/465nm 检测，从而实现对 MMP-3 活性的监测。
研究进展：目前主要应用于 MMP-3 相关的研究中，通过检测该底物的水解情况来定量分析 MMP-3 的活性。在基础科研领域，有助于深入了解 MMP-3 在生理和病理过程中的作用机制，例如在肿瘤侵袭和转移过程中，MMP-3 的活性变化对细胞外基质的重塑起到关键作用，通过该底物可监测 MMP-3 在肿瘤微环境中的活性动态。在药物研发方面，可作为筛选 MMP-3 抑制剂的工具，评估候选药物对 MMP-3 活性的抑制效果，为开发针对 MMP-3 相关疾病的治疗药物提供实验依据。

溶解保存

溶解：可先尝试使用无菌水或缓冲液（如磷酸盐缓冲液 PBS）进行溶解，因为多肽含有极性基团和带电荷氨基酸残基，在这些溶剂中应有一定溶解性。若溶解困难，可尝试使用少量的有机溶剂如二甲基亚砜（DMSO）辅助溶解，但在细胞实验等应用中，需注意 DMSO 终浓度一般应控制在 0.1% 以下，并设置对照，避免其对实验结果产生干扰。
保存：一般建议以冻干粉形式保存，将其置于 - 20℃或更低温度（如 - 80℃）的环境中，可保持较好的稳定性，保质期可达数年。若为溶液状态，应分装保存，避免反复冻融，因为反复冻融可能导致多肽结构破坏，影响其作为 MMP-3 底物的活性。