讨论药物流产与无痛人流时，需了解两者本质上的差异。无痛人流在过去十到二十年间因宣传其过程无痛而广受欢迎，许多女性在面对非意愿妊娠时倾向于选择这种方式。然而，生殖科医生们观察到，经历过无痛人流的女性，在她们真正想要生育时，往往会遇到一些并发症。例如，无痛人流过程中可能损伤子宫内膜基底层，或引发宫腔炎症导致粘连，进而影响胚胎着床，这对计划怀孕的女性来说是个挑战。这种情况相当普遍，因此，不少生殖科医生对无痛人流持保留态度，尤其是考虑到一些实施该手术的机构缺乏足够资质，或操作医生经验不足，可能导致操作过度，伤害到子宫内膜再生层。
相比之下，药物流产在符合条件的情况下（即妊娠时间尚早），被视作更为推荐的选择。据统计，约90%的药物流产能够完全清除妊娠组织，其对女性身体的影响相对较小，类似于一次月经量稍多的情况。即使有10%的案例可能出现残留，但通常残留物不大，通过医生指导下的后续处理，可以有效清除，减少对未来的生育影响，整体痛苦也相对较低。
面对非意愿妊娠，若条件允许，药物流产因其较低的侵入性和对将来生育的较小影响，成为了一个值得考虑的选项。
